染色质免疫共沉淀ChIP

染色质免疫共沉淀(ChromatinImmnoprecipitation,ChIP)是研究体内DNA与蛋白质相互作用的一种技术。它在活细胞状态下固定蛋白质－DNA复合物，并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段，然后利用抗原抗体反应的特异性，特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段，通过对目的片段的纯化与检测分析，获得蛋白质与DNA相互作用的信息。可以真实地反映体内蛋白因子与基因组DNA结合的状况，当需要了解某特异的DNA结合蛋白所结合的DNA序列时，该技术是最好的方法；还可以对基因组中的组蛋白修饰进行分析定位，从而研究组蛋白的各种共价修饰与基因转录调控的关系。ChIP-qPCR是利用荧光实时定量PCR检测ChIP样品的常用手段。ChIP-qPCR技术实现了在靶基因的启动子上找到转录因子结合的直接证据，是细胞内真实的、原位的结果，同时可以比较与不同位点的结合能力的比较,相对于EMSA、luciferase报告载体等体外实验验证更具说服力。